牛樟芝鲨烯环氧酶基因的克隆、生物信息学及表达分析

摘要：

目的 克隆牛樟芝三萜合成途径中鲨烯环氧酶基因(AcSE),并进行生物信息学和表达差异分析.方法 以牛樟芝菌丝体cDNA为模板,利用快速末端扩增(RACE)进行AcSE序列扩增,利用生物信息学分析AcSE基因的理化性质并预测其蛋白二级结构、三级结构及其功能;同时利用实时荧光定量PCR (qRT-PCR)测定不同培养时间的液体牛樟芝菌丝体及子实体中AcSE基因的表达情况.结果 AcSE的cDNA全长1446bp (GenBank编号:KT070558),编码481个氨基酸,相对分子质量为53 300,等电点为6.36.结构域分析表明AcSE内含3个跨膜的结构域,无卷曲螺旋结构,且疏水区和亲水区交替存在.AcSE的gDNA全长为1 607 bp,含4个外显子和3个内含子.AcSE在液体培养7d的牛樟芝菌丝体中表达量最高,为子实体的7.89倍,且随着培养时间的延长逐渐下降.结论 首次从牛樟芝中克隆了AcSE基因,为进一步阐明该基因在牛樟芝三萜合成途径中的作用奠定基础.

关键词：牛樟芝、鲨烯环氧酶、生物信息学、实时荧光定量PCR、RACE

所属期刊栏目：49

分类号：R282.12(中药学)

资助基金：福建农林大学发展研究基金“牛樟芝三萜合成关键酶SE互作蛋白筛选及功能分析”KF2015111;福建省2011计划“菌草生态产业协同创新中心”K80ND8002

在线出版日期：2018-08-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：2440-2446