SCoT分子标记对茶枝柑及近缘种遗传多态性分析

摘要：

目的 采用SCoT分子标记方法对茶枝柑及近缘种进行遗传多态性分析.方法 使用正交设计方法,对Mg2+、dNTPs、ExTaq DNA聚合酶、引物浓度及模板DNA用量5个因素进行筛选,筛选适合茶枝柑及近缘种的SCoT-PCR反应体系,同时通过梯度温度筛选最佳退火温度,并验证其多态性引物.结果 得到适于茶枝柑的SCoT标记PCR反应体系,最终筛选出12条清晰、条带丰富的作为茶枝柑及近缘种SCoT分子标记的引物,同时通过NTSYS软件分析得到茶枝柑及近缘种的相似系数表和UPGMA聚类树.结论 运用3个不同地域柑橘基因组DNA对优化的SCoT-PCR反应体系进行验证,获得了多态性丰富、条带清晰的扩增图谱,表明茶枝柑SCoT分子标记技术体系稳定可靠.而聚类分析结果能够直观、科学地从分子角度对茶枝柑及近缘种13种材料进行初步区分.

关键词：茶枝柑、SCoT分子标记、正交设计、遗传多样性、PCR反应

所属期刊栏目：49

分类号：R282.12(中药学)

资助基金：广东省教育厅高校重点实验室滚动支持项目“春砂仁等十大广药DNA条形码标准化研究”2013CXZDA011;国家公益性行业科研专项201407002

在线出版日期：2018-08-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：2426-2431