珊瑚菜GlPS1、GlPS2基因克隆及表达分析

摘要：

目的 克隆珊瑚菜Glehnia littoralis补骨脂素合成酶(psoralen synthase,PS)基因全长cDNA序列,并进行生物信息学和表达量分析.方法 在前期珊瑚菜转录组测序的基础上,筛选出表达量较高的2条PS基因G1PS1和GlPS2序列.利用cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)方法对2个基因cDNA序列3'端进行克隆,DNAMAN拼接后得到基因全长cDNA序列,并对其编码蛋白进行生物信息学分析.利用实时荧光定量PCR (RT-qPCR)方法检测GlPS1和GlPS2基因的组织特异性表达.结果 G1PS1和G1PS2基因cDNA序列全长分别为1 885 bp和l 971 bp,编码495和502个氨基酸残基,蛋白相对分子质量分别为55 740.7和56 363.9,等电点为8.28和6.62,均属于细胞色素P450超家族,含有1个跨膜区,为亲水性蛋白.系统进化分析表明,G1PS1和G1PS2与伞形科欧防风Pastinaca sativa、旱芹Apium graveolens、大阿米芹Ammi majus PS蛋白亲缘关系较近.RT-qPCR结果显示GlPS1基因在根中表达量较高,在叶中表达量较低,而G1PS2基因在花中表达量较高,在根中表达量较低.结论 首次获得珊瑚菜GlPS1和GlPS2基因的全长cDNA序列并进行了表达分析,为进一步开展珊瑚菜补骨脂素合成酶基因的功能和遗传调控机制研究奠定基础.

关键词：珊瑚菜、补骨脂素合成酶、RACE、生物信息学分析、组织特异性表达

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分类号：R282.12(中药学)

资助基金：国家自然科学基金青年项目31500230;上海市资源植物功能基因组学重点实验室开放课题PFGR20170;山东省青岛市青年教师成长计划经费资助项目

在线出版日期：2018-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1139-1145