罗马洋甘菊吉马烯A合成酶基因的克隆与表达分析

摘要：

目的 从罗马洋甘菊Chamaemelum nobile中克隆萜类化合物合成关键酶吉马烯A合成酶(germacrene A synthase, GAS) cDNA全长,并对其进行生物信息学和组织表达分析.方法 基于前期对罗马洋甘菊转录组测序结果,设计特异性引物,利用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增得到GAS的cDNA全长,利用生物信息学手段对其核苷酸和编码的氨基酸序列进行分析,并预测其编码的蛋白质的理化性质和功能.通过实时定量PCR技术(qRT-PCR)检测罗马洋甘菊GAS基因(CnGAS)在罗马洋甘菊不同组织的表达水平.结果 扩增得到的罗马洋甘菊吉马烯A合成酶基因的cDNA全长为1 785 bp,命名为CnGAS(GenBank登录号为KU589283),包含1个1 683 bp的开放阅读框(ORF),编码561个氨基酸,预测的相对分子质量和等电点分别为6 470和5.21.CnGAS基因编码的氨基酸序列与其他植物的GAS蛋白高度同源,且含有DDxxD保守序列.系统进化树表明CnGAS基因与菊科植物的GAS基因的亲缘关系最近.qRT-PCR结果显示CnGAS基因在罗马洋甘菊各组织中均有表达,且花中表达量最高.结论 从罗马洋甘菊中克隆得到CnGAS基因,分析了该基因在不同组织中的表达水平,为罗马洋甘菊萜类化合物的生物合成代谢途径的研究奠定了基础.

关键词：罗马洋甘菊、吉马烯A合成酶、基因克隆、生物信息学、基因表达

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分类号：R282.12(中药学)

资助基金：国家自然科学基金资助项目31400603;大学生创新创业训练计划项目201207014

在线出版日期：2017-07-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1851-1859