不同地理居群破布叶的psbA-trnH和ITS2序列及其聚类分析

摘要：

目的 探讨破布叶Microcos paniculata不同地理居群间的DNA序列变异与地理分布的关系,为其种质资源评价和基原植物的分子鉴定提供参考.方法 对破布叶14个居群14份个体样品以改良的3×CTAB法提取基因组DNA,选择特异的引物扩增ITS2和psbA-trnH序列;PCR扩增产物直接双向测序分析.DNAMAN 8.0软件处理测序数据,MEGA6.0软件计算K2P遗传距离,运用NJ法构建系统聚类树.结果 破布叶14个居群的ITS2序列均为462 bp,共检测到14个变异位点,居群间遗传距离0.000 0～0.019 8.除云南景洪居群样本的psbA-trnH序列存在8bp缺失外,其他13个居群样本的psbA-tmH序列均长387 bp,无变异,居群间遗传距离为0.000 0.结论 不同地理居群破布叶的psbA-trnH较ITS2更为保守,二者PCR扩增引物特异性好,扩增效率和测序成功率高,对其药材及基原植物的分子鉴定可采用psbA-trnH为主,ITS2序列为辅的DNA条形码技术.

关键词：破布叶、psbA-trnH、ITS2、DNA条形码、分子鉴定

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分类号：R282.12(中药学)

资助基金：国家自然科学基金项目31300273;广东省科技计划项目2015A030302082

在线出版日期：2017-06-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1403-1408