白木香倍半萜合成酶基因As-SesTPS的克隆及生物信息学与表达分析

摘要：

目的 从白木香Aquilaria sinensis总RNA中克隆倍半萜合成酶基因,并对其进行生物信息学及表达分析.方法 对白木香总RNA进行反转录聚合酶链式反应(reverse transcription-PCR,RT-PCR)和cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE),获得完整的开放阅读框(ORF).运用生物信息学的方法对该序列进行相似性比较和同源性分析,预测编码蛋白,并对其进行各种理化性质分析.通过半定量PCR检测该基因在白木香树干中不同部位的表达情况.结果 获得As-SesTPS基因,ORF长1 629 bp,编码542个氨基酸,与葡萄Vitis vinifera的大根香叶烯-D合成酶[(-)-germacrene D synthas相似性最高,且包含RRx8W和DDxxD的保守序列.As-SesTPS蛋白无跨膜区域,定位于细胞质中,且仅在白木香结香部位表达.结论 首次从白木香中克隆得到可能编码大根香叶烯-D合成酶的基因,为白木香倍半萜生物合成代谢途径的研究提供参考.

关键词：白木香、倍半萜合成酶、基因克隆、生物信息学、基因表达分析

所属期刊栏目：45

分类号：R286.12(中药学)

资助基金：国家自然科学基金资助项目31100496,81102418;广东省中国科学院全面战略合作项目2011B090300078;广东省科技计划项目2012A030100014

在线出版日期：2014-03-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：94-101