碎米桠及其近缘种的分子鉴定和亲缘关系研究

摘要：

目的 构建碎米桠Isodon rubescens及其与近缘种之间系统发育关系,准确鉴别碎米桠及其近缘种.方法 提取碎米桠及其近缘种DNA,对核基因ITS片段和叶绿体基因psbA-trnH序列扩增和测序,计算物种种内、种间Kimura 2-parameter(K2P)遗传距离.采用最近距离、相似性搜索、构建Neighbor-joining (NJ)系统聚类树3种方法进行鉴定分析.结果 ITS和sbA-trnH 分子系统树支持碎米桠5个居群样本聚为一单系分支,支持率为94％和68％；其中,碎米桠与毛叶香茶菜、香茶菜和内折香茶菜聚在一支,支持率为70％和51％；溪黄草和显脉香茶菜构成姐妹群分支,支持率为81％和63％.碎米桠及其近缘种种间ITS和sbA-trnH序列的K2P遗传距离为0.007 08～0.072 61和0.008 06～0.024 76,均远大于碎米桠种内的遗传距离0～0.001 76和0～0.002 68.结论 碎米桠与毛叶香茶菜、香茶菜和内折香茶菜亲缘关系较近,溪黄草和显脉香茶菜亲缘关系最近.ITS和sbA-trnH序列可以准确鉴别碎米桠及其近缘种.

关键词：ITS、psbA-trnH、碎米桠、鉴定、亲缘关系

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分类号：R282.12(中药学)

资助基金：国家自然科学基金面上项目31070171,31270236;科技部国家星火计划项目2012GA750004

在线出版日期：2013-12-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：2904-2909