宁夏枸杞查耳酮合成酶基因cDNA片段的克隆及生物信息学分析

摘要：

目的 克隆宁夏枸杞类黄酮/异黄酮生物合成途径中的关键酶查耳酮合成酶(CHS,EC2.3.1.74).方法 以宁夏枸杞为材料,利用同源克隆和RT-PCR技术得到1条CHS基因,并对其进行生物信息学分析.结果 该家族的cDNA片段长为1 148 bp,编码382个氨基酸,蛋白相对分子质量为4.168×104,等电点为6.22.氨基酸序列和结构分析显示CHS基因家族有一个活性位点,即查耳酮和二苯乙烯合成酶活性位点.宁夏枸杞CHS (LyCHS)蛋白很可能定位在细胞质.对二级结构和三级结构进行预测,发现LyCHS蛋白中无规则卷曲126个,α螺旋和β折叠分别为166和25个,延伸链65个.系统进化分析表明,LyCHS基因与马铃薯野生种、马铃薯、番茄具有很高的同源性.该基因已在GenBank上注册,基因序列登录号为JQ964237.结论 首次克隆了LyCHS基因片段,为研究其表达特性以及功能提供了基础.

关键词：枸杞、CHS基因、克隆、生物信息学分析、LyCHS蛋白

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分类号：R282.12(中药学)

资助基金：北方民族大学校级科研项目2010Y046

在线出版日期：2013-12-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：2898-2903