金龙胆草3-磷酸甘油醛脱氢酶基因的克隆及序列分析

摘要：

目的 对金龙胆草Conyza blinii3-磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH)基因进行克隆及序列分析,并检测其是否可作为金龙胆草的内参基因.方法 采用RACE技术克隆金龙胆草GAPDH基因的cDNA全长序列,利用DNAMAN、BLAST、MEGA等工具对序列进行生物信息学分析,并以其为内参进行半定量RT-PCR.结果 克隆获得了1个全长1 418 bp的GAPDH基因,完整开放阅读框1020 bp,编码340个氨基酸,命名为GLGAPDH.序列比对结果显示,金龙胆草的GAPDH基因与紫背天葵的同源序列相似性达到96％,与薇甘菊的同源序列相似性为93％.通过系统进化树分析发现其与紫背天葵的亲缘关系最近.半定量RT-PCR分析GLGAPDH作为内参基因在不同组织中表达稳定,扩增效果良好,重现性强.结论 首次克隆了金龙胆草GAPDH基因的全长cDNA序列,并通过半定量实验验证了其可作为内参基因用于基因表达量分析,为金龙胆草次生代谢物合成过程中关键酶表达分析及调控机制的研究奠定了基础.

关键词：金龙胆草、3-磷酸甘油醛脱氢酶基因、克隆、序列分析、内参基因

所属期刊栏目：44

分类号：R282.12(中药学)

资助基金：四川省科技创新苗子工程资助项目2012ZZ046

在线出版日期：2013-11-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：2732-2735