龙骨马尾杉PcFPS1基因克隆及序列分析

摘要：

目的 对龙骨马尾杉Phlegmariurus carinatus法呢二磷酸合成酶(Farnesyl diphosphate synthase,FPS)基因PcFPS1编码区进行克隆及序列分析.方法 根据已获得的龙骨马尾杉转录组数据,从中获得1条编码FPS的转录本,采用RT-PCR方法获得PcFPS1的编码区序列,并对PcFPS1蛋白进行理化性质、蛋白二级结构及三维结构预测分析.结果 序列分析表明,所克隆的PcFPS1基因编码区长为1 119 bp,编码372个氨基酸残基,PcFPS1与挪威云杉Picea abies的FPS具有70％的序列相似性.生物信息学预测PcFPS1蛋白基本不含跨膜区,具有萜类合酶保守结构域,不含信号肽.结论 首次获得龙骨马尾杉PcFPS1基因的编码区序列,为进一步研究PcFPS1在石杉科植物萜类及甾醇类化合物生物合成途径中的功能及鉴定酶活性位点奠定基础.

关键词：法呢二磷酸合成酶、龙骨马尾杉、次生代谢、三萜、克隆

所属期刊栏目：44

分类号：R282.12(中药学)

资助基金：国家自然科学基金项目“基于宏量ESTs的蛇足石杉转录组分析及石杉碱甲合成酶HAS的鉴定研究”30900113;2011年度教育部“长江学者和创新团队发展计划”IRT1150

在线出版日期：2013-11-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：2587-2592