千里光全长cDNA文库的构建及分析
目的 构建千里光全长cDNA文库,以期研究千里光的功能基因组学信息,为克隆药理学性状相关的功能基因提供数据资源.方法 Trizol法提取千里光叶片总RNA,通过SMART(switching mechanism at 5’end of RNA transcript)构建全长cDNA文库,随机挑取600个单克隆测序分析文库滴度、全长率及冗余率,得到的EST序列进行Blast分析(NR、NT、Swiss-Prot、KEGG)及COG功能分类.结果 文库的库容为4.3×106 cfu/mL,插入片段大小平均1.7 kb,文库重组率96.35％,全长率58.24％,冗余率10.88％;获得524条全长EST序列,含有467条独立基因(unigenes),其中5条序列与千里光次生代谢产物的合成、运输与代谢有关.结论 经检测,SMART技术成功构建了千里光全长cDNA文库,该文库可用于千里光功能基因组鉴定、新基因筛选及次生代谢产物生物合成的表达调控研究.
千里光、全长cDNA文库、SMART、EST、基因组学
43
R282.12(中药学)
2012-07-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
557-561
