应用于小鼠早期胚胎细胞的ChIP-seq体系中基因组水解酶的筛选

摘要：

在过去的十几年中,染色质免疫共沉淀测序技术(ChIP-seq)成为了分析表观基因组和鉴定DNA相关蛋白重要结合位点的主要技术.然而,ChIP-seq技术目前仍存在一些技术难点.其中一个重要限制是ChIP-seq需要大量的起始材料,需要至少数百万个细胞才能启动,然而实验中有两个关键步骤往往会造成所使用的样本丢失,即染色质制备和免疫沉淀.本实验通过从染色体制备入手,通过选择两种不同核酸水解酶DNase和MNase,设计不同实验组验证最佳酶切浓度,以优化ChIP-seq体系.结果 证明0.1U/μL的MNase为本实验中ChIP-seq最佳酶切浓度.结果 为ChIP-seq体系的优化提供了参考,对ChIP-seq技术在小鼠早期胚胎细胞中的应用以及发展有一定的积极意义.

关键词：小鼠早期胚胎、ChIP-seq、核酸水解酶、酶切效率

分类号：S865.1(狩猎、野生动物驯养)

在线出版日期：2020-03-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：8-11