TNFSF13B通过影响肿瘤微环境免疫细胞不利于肾透明细胞癌的预后

摘要：

目的:通过生物信息学的方法对肾透明细胞癌(kidney renal clear cell carcinoma,KIRC)的肿瘤微环境(tumor microenvironment,TME)进行分析,确定与其关键基因相关的肿瘤浸润免疫细胞(tumor-infiltrating immune cells,TICs)的组成,揭示关键基因的独立预后价值.方法:应用CIBERSORT和ESTIMATE计算方法,从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中计算了611例KIRC患者免疫和基质成分的数量和TICs的比例.通过对差异表达基因进行分析并进行Cox回归分析和构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(protein protein interaction network,PPI),再通过单因素Cox与PPI的交集分析,确定肿瘤坏死因子超家族13b(TNFSF13B)为预测因子.进一步对TNFSF13B的表达进行差异分析、生存分析、临床相关性分析、基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)、TICs组成比例及相关性分析.结果:TNFSF13B的表达与KIRC患者的生存期呈负相关.GSEA表明,高表达TNFSF13B组的基因主要富集在免疫活性细胞中.对TICs比例的CIBERSORT分析表明,调节性T细胞(Treg)和T细胞滤泡辅助因子(Tfh)与TNFSF13B表达呈正相关,但幼稚B细胞和静息肥大细胞与TNFSF13B表达呈负相关,提示TNFSF13B可能负责调控TME的免疫细胞成分.结论:TNFSF13B的表达水平可能不利于KIRC患者的预后,特别可能通过影响TME的免疫成分发挥作用,同时也揭示了TNFSF13B作为免疫治疗发展的潜在靶点和生物标志物.

关键词：TNFSF13B、肿瘤微环境、ESTIMATE、CIBERSORT、肿瘤浸润免疫细胞、肾透明细胞癌

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资助基金：安徽省中央指导地方科技发展专项项目;皖南医学院重点研究项目培育基金

在线出版日期：2021-05-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：107-113