PCR技术鉴定南水北调中线水源地淡水虾囊蚴并行系统进化分析

摘要：

目的:基于PCR结合测序分析建立一种准确判断淡水虾类感染吸虫囊蚴的分子鉴定方法,并对其系统进化进行分析,追溯其起源.方法:采用肌肉压片直接挑取法取出囊蚴,试剂盒提取基因组DNA.用吸虫通用引物对所提DNA进行PCR扩增,琼脂糖凝胶电泳鉴定.PCR阳性样本采用各类吸虫特异性引物分别进行扩增,PCR产物电泳鉴定,阳性样本送公司进行双向测序.使用DNAstar软件拼接序列,离线软件MEGA5比对测序结果并建立系统进化树并分析其起源.结果:制作虾肌肉压片20张共挑取囊蚴32个,获取了囊蚴基因组DNA.三对通用引物均扩出480 bp左右的单一条带.吸虫特异性引物扩增时,仅有针对于吸虫异形科的ITS2和28S rRNA序列分别扩增出了约480 bp和1 300 bp的特异性条带.软件分别拼接出了419 bp和770 bp的截断序列.系统进化树分析显示,虾类所感染吸虫囊蚴有两种,分别与Neochoanostoma spp和Dimerosaccus oncorhynchi高度同源.结论:应用PCR结合测序分析在十堰地区首次建立了淡水虾类囊蚴的分子鉴定方法,为我国吸虫系统分类和南水北调中线水源地食源性吸虫病的研究奠定了基础.

关键词：吸虫、囊蚴、PCR、系统进化树

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分类号：S96;TS2

资助基金：教育部留学回国人员启动金JYB201448HBMU01;湖北医药学院研究生启动金2013QDJZR04;十堰市科学技术研究与开发项目14Y05;校级重点学科建设项目2014XKJSXJ04

在线出版日期：2017-05-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：439-444