10.19675/j.cnki.1006-687x.2019.10009
龙眼纤维素合成酶基因家族成员鉴定及表达模式
为探究龙眼纤维素合成酶(cellulose synthase,CESA)家族的生物学功能,采用生物信息学分析方法进行龙眼C ESA (DICESA)家族成员鉴定、蛋白特性和保守基序分析、分子进化树分析、FPKM值分析,并利用qRT-PCR技术分析DICESA基因的表达模式.结果表明,DICESA家族包含9个基因成员,家族成员内含子数量8-13个不等,且蛋白理化性质相近,均包含15个保守的motif;系统进化树分析表明DICESA分布于6个分支上;顺式作用元件分析表明DICESA家族启动子序列含有众多植物激素响应、厌氧响应等元件;FPKM值分析表明DICESA家族在NEC阶段高表达,大部分成员在体胚发生过程中呈现下调表达趋势;除DICESA7-2外其余DICESA基因在龙眼不同组织部位都有所表达.qRT-PCR分析表明,4个DICESA基因在非胚性阶段表达量较高;DICESA成员可被ABA和MeJA下调表达.本研究表明DICESA可能参与龙眼生殖生长和体胚发生进程,并响应逆境胁迫.
龙眼、纤维素合成酶、生物信息学分析、表达分析
26
S563.2;S792.153.01;Q786
国家自然科学基金;福建省高原学科建设经费;创新基金
2020-12-10(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共9页
1235-1243