龙眼漆酶家族成员全基因组结构与功能分析

摘要：

为了解龙眼漆酶 (DlLAC) 家族的生物学功能, 采用生物信息学分析方法进行龙眼基因组LAC基因成员鉴定, 蛋白结构域及特性、启动子顺式作用元件、分子进化树分析、体胚发生过程和组织器官特异表达的FPKM分析以及可能互作的mi RNA预测.结果显示:DlLAC家族基因包含42个基因成员, 分为7大类;基因家族成员内含子数量1-8个不等, 以5个为主, 其中DlLAC15-1中存在600 bp短串联重复序列;DlLAC蛋白结构域共存在5种类型, 均属于铜蓝蛋白, 以3个铜蓝氧化酶结构域为主;DlLAC蛋白均为分泌型蛋白, 亚细胞定位预测在胞外, 包含2个以上糖基化位点, 具有多个保守的motif;5端调控序列预测分析, DlLAC可能具有多个转录起始位点;DlLACp启动子序列均包含大量非生物胁迫应激响应元件、胚乳特异表达元件及MYB结合位点, 推测MYB可能通过DlLAC进而调控龙眼胚胎发育.DlLAC9-1p、DlLAC12p、DlLAC17-2p含黄酮类化合物合成调控的MYB结合位点, 可能参与龙眼生长发育过程中种子成熟和果皮成色的色素合成途径;DlLAC家族成员可能参与不同体胚发育过程和不同组织器官形态建成.42个龙眼漆酶成员共有28个受miRNA调控, 13个成员受miR397调控, 可能与木质素合成相关, 8个成员受miR1535调控.非miR397调控的成员可能发挥其他重要的生物学功能.本研究表明, DlLAC家族成员在龙眼生长发育过程中除了参与木质素合成以外, 还可能参与胚胎发育、胚乳发育、色素合成、组织器官特异表达等重要生物学功能, 表现其功能上的多样性.

关键词：龙眼、漆酶家族、成员鉴定、功能分析、miRNA预测

所属期刊栏目：24

分类号：S667.203(果树园艺)

资助基金：国家自然科学基金项目31572088, 31672127;福建省科技重大专项 2015NZ0002-1 资助;the National Natural Science Foundation of China31572088, 31672127;the Major Science and Technology Program of Fujian Province2015NZ0002-1

在线出版日期：2018-10-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：833-844