中华猕猴桃EIN3/EIL转录因子家族的成员鉴定、系统进化和基因表达模式

摘要：

EIN3/EIL家族是一类非常重要的转录因子,调控植物包括果实成熟在内的众多生长发育过程. 对中华猕猴桃EIN3/EIL家族进行系统的生物信息学和比较基因组学研究,在中华猕猴桃基因组中鉴定得到8个EIN3/EIL转录因子;其蛋白序列包括1个酸性氨基酸富集区、1个脯氨酸富集区以及5-7个碱性氨基酸富集区. 包括中华猕猴桃在内的20种植物的EIN3/EIL成员的系统进化树表明,EIN3/EIL基因在众多植物基因组中同时存在趋同和趋异的进化趋势. 中华猕猴桃EIN3/EIL基因家族成员的增加主要源于其进化过程中发生的全基因组三倍化倍增事件. 在果实成熟过程中,中华猕猴桃EIN3/EIL基因呈现组成型的高或低表达两种截然相反的基因表达趋势. 本研究鉴定得到了中华猕猴桃EIN3/EIL家族的成员,系统揭示了其成员蛋白序列中的保守区域、在不同植物物种中的进化趋势,植物基因组倍增所导致的家族成员增加,以及果实发育过程中表现出的显著的基因表达水平差异,可为中华猕猴桃EIN3/EIL基因的功能研究提供候选基因以及数据基础. (图5 表2 参25)

关键词：中华猕猴桃、EIN3/EIL、系统进化、比较基因组学分析、基因表达模式

所属期刊栏目：24

分类号：Q349.5;S663.403(遗传学分支学科)

资助基金：国家自然科学基金青年科学基金31440028;面上项目31671266;中国博士后科学基金面上项目2013M541824资助. Supported by the National Natural Science Foundation of China31440028, 31671266;the China Postdoctoral Science Foundation2013M541824

在线出版日期：2018-08-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：315-321