野生蕉miR395a前体克隆与进化特性及启动子分析

摘要：

植物miR395参与硫代谢调控,并在应答逆境胁迫等方面起重要调控作用.为了解香蕉miR395的分子特性和进化规律,在参考香蕉基因组信息的基础上,结合RT-PCR技术,从三明野生蕉(Musa itinerans)叶片中获得81 nt miR395a前体序列,包含21 nt miR395a成熟体序列.进化特性分析表明,植物miR395a前体存在于27个物种中,野生蕉pre-miR395a序列与双子叶耧斗菜(Aquilegia viridiflora Pall.)最为接近,与单子叶的水稻、玉米、高梁最远,表明野生蕉pre-miR395a的起源比较特殊;前体序列长度差异较大(57-226 nt);miR395a成熟体序列分析发现,来自5p臂上的miR395a序列特异性较大.野生蕉miR395a前体能形成典型的发卡结构,miR395a成熟体位于前体的3p臂上.转录起始位点分析表明,野生蕉pri-miR395a转录起始区域位于-87 bp--38 bp,A为转录起始位点.启动子顺式作用元件预测分析表明,野生蕉miR395a启动子包含多个激素、胁迫、生物钟及光响应元件,可能与响应胁迫密切相关.qPCR检测结果也发现miR395a的表达量在低温胁迫下极显著下调,表明响应低温胁迫.综上表明三明野生蕉在响应低温胁迫过程中miR395a起着重要调控作用,这对于进一步研究野生蕉miR395a在低温胁迫中的作用机制具有参考价值.

关键词：野生蕉、pre-miR395a、克隆、进化特性、启动子分析、qPCR

所属期刊栏目：24

分类号：S668.101;Q78(果树园艺)

资助基金：福建省重大科技专项2015NZ0002-1;国家现代农业产业产业技术体系香蕉专项资金CARS-31-15资助 Supported by the Major Science and Technology Program of Fujian Province of China2015NZ0002;the Earmarked Fund for China Agriculture Research System of BananaCARS-31-15

在线出版日期：2018-05-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：89-96