植物miR408家族的进化与分子特性

摘要：

miR408家族在植物上已有报道,但其进化规律与分子特性研究很少.利用miRbase数据库提供的34种植物49个miR408的前体序列和64个成熟体序列,采用分类统计、进化树构建、序列比对、二级结构预测、染色体定位分析及靶基因预测等手段,进行进化规律与分子特性分析.结果显示:miR408家族成员分布在34个植物物种中,分布较为广泛,并且苔藓类植物可能是植物miR408家族进化的祖先;物种特异性是影响miR408前体进化特性的重要因素,而序列保守性是影响成熟体进化特性的主要因素;由5p臂上形成的miR408成熟体的序列特异性较大,由3p臂上形成的miR408成熟体的序列保守较高;Mfold预测表明植物miR408家族具有典型的茎环二级结构,茎序列的保守性高于环序列,3p臂上茎序列的保守性高于5p臂上茎序列;靶基因预测表明miR408广泛参与植物生长发育和逆境胁迫的应答.综上表明植物miR408家族成员在进化过程中保守性与特异性并存,这对进一步研究植物miR408的生物学功能具有参考价值.

关键词：植物、miR408家族、进化规律、分子特征、靶基因预测

所属期刊栏目：23

分类号：Q74;S184(生物小分子的结构和功能)

资助基金：福建省重大科技专项2015NZ0002-1;国家现代农业产业产业技术体系香蕉专项资金CARS-31-15资助 Supported by the Major Science and Technology Program of Fujian Province,China2015NZ0002;the Earmarked Fund for China Agriculture Research System of BananaCARS-31-15

在线出版日期：2018-03-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1042-1051