甘蔗真核生物翻译起始因子5A基因的克隆与表达分析
真核生物翻译起始因子5A(Eukaryotic translation initiation factor 5A,eIF5A)是一种在动植物和真菌体内普遍存在的蛋白质.为了解eIF5A基因在甘蔗应答生物逆境胁迫中的作用,本研究首先从黑穗病菌胁迫下甘蔗抑制消减杂交(Suppression subtractive hybridization,SSH)文库中获得一条与玉米eIF5A基因(GenBank Accession Number:EU958725.1)同源性为93％的甘蔗EST序列;其次,以此序列作为探针,通过电子克隆技术获得一条甘蔗eIF5A基因的cDNA拼接序列;最后,经RT-PCR扩增和测序验证,结果显示电子克隆序列与测序序列一致,将该序列命名为SceIF5A(GenBank Accession Number:KJ577595).生物信息学分析显示,SceIF5A基因cDNA全长1 174 bp,含有长度为483 bp、编码160个氨基酸的完整开放读码框;SceIF5A蛋白是酸性稳定蛋白,分子量(Mr)为17 453.6,含有12个保守氨基酸序列,推测定位于细胞质.实时荧光定量PCR(Real-time quantitative PCR,RT-qPCR)分析结果表明,在黑穗病菌、水杨酸、茉莉酸甲酯、脱落酸胁迫下,SceIF5A均上调表达,推测SceIF5A基因在甘蔗响应黑穗病菌侵染过程中被诱导表达,且其表达受内源激素信号通路的调控.本研究获得的SceIF5A基因的结构特征和功能作用模式为研究该基因在甘蔗与黑穗病菌互作中的作用积累了基础数据.
甘蔗、真核生物翻译起始因子5A、甘蔗黑穗病菌、生物信息学、实时荧光定量PCR
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Q78;S566.103.4(基因工程（遗传工程）)
2016-03-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
1120-1127
