番茄bZIP转录因子家族的生物信息学分析
bZIP转录因子广泛参与了植物生长发育以及抗逆应答的调控,属于重要的转录因子家族.为了系统地阐明番茄bZIP转录因子家族成员特征和基因表达模式,利用生物信息学软件和方法,对番茄基因组中的bZIP转录因子进行了系统的分析研究.结果表明:番茄基因组共编码70个bZIP转录因子基因,划分为14个亚族,即A、B、C、D、E、F、G、H、I、J、K、L、S和X.番茄、拟南芥和水稻bZIP基因的系统进化树揭示了进化过程中Group 3和Group 4的成员数目大大增加,进化过程较激烈.氨基酸保守域DOG1和MFMR分别特定存在于12个和6个bZIP成员蛋白序列中.在番茄各器官组织中,干旱、盐、细菌和病毒侵染胁迫条件下,43个番茄bZIP基因不同程度地被诱导表达.以基因表达值上调或下调1.5倍为阈值,部分bZIP基因的表达水平被显著地诱导上调或下调表达.这些基因很可能参与了调控番茄的果实等组织的生长发育,以及逆境胁迫条件下的防御应答反应.通过荧光实时定量PCR,其中7个代表性番茄bZIP基因,被进一步验证了在叶片和果实中的表达水平.本研究鉴定得到的番茄bZIP转录因子基因,可用于今后番茄育种及改良的基因工程研究.
番茄、bZIP、转录因子、生物信息学分析
20
S641.203.4
国家自然科学基金项目31171179、中国博士后科学基金面上项目2013M541824和中央高校基本科研业务费专项资金2012HGQC0018,2013HGBZ0168资助; Supported by the National Natural Science Foundation of China 31171179,the China Postdoctoral Science Foundation 2013M541824 and the Fundamental Research Funds for the Central Universities 2012HGQC0018,2013HGBZ0168
2014-12-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
767-774
