Porphyrobacter sp. D22F的降解特性及其在石油降解菌群中的生态位
为揭示多环芳烃(Polycyclic aromatic hydrocarbons,PAHs)降解微生物资源的多样性和石油降解菌群的优势菌,研究了从南海沉积物中分离得到的一株PAHs降解菌D22F的降解特性及其在石油降解菌群D22-1中的生态位.对菌株D22F进行16S rRNA基因同源性分析及透射电镜观察以初步确定其种属,通过培养法、气相色谱质谱联用(GC-MS)测定其多环芳烃降解范围和降解率,通过简并引物PCR扩增其PAHs双加氧酶大亚基基因片段并进行系统发育分析,采用变性梯度凝胶电泳(DGGE)监测石油降解菌群中的优势菌.结果表明,与菌株D22F的16S rRNA基因相似度最高的模式株为产卟啉杆菌属Porphyrobacter tepidarius DSM 10594T( AF465839; 98.55％).该菌株能降解萘、甲基萘、苊、硫芴、菲、蒽等；对初始浓度为0.2 g/L菲10 d后的降解率可达90％以上.从其基因组DNA中克隆到的PAHs起始双加氧酶大亚基基因phnAc与Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444中的质粒pNL1 (CP000676)上的bphA1f基因相似度最高,达到99.41％.DGGE谱图显示,菌株D22F是石油降解菌群中的3种优势菌之一,在传代菌群中可稳定存在.Porphyrobacter sp.D22F为产卟啉杆菌属(Porphyrobacter)中首株以低分子量PAHs为唯一碳源和能源的菌株,是石油降解菌群的优势菌.
多环芳烃、产卟啉杆菌属、生物降解、起始双加氧酶、优势菌、生态位
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X172;Q938.15(环境生物学)
国家自然科学基金;公益性行业科研专项;国家自然科学基金;基本科研业务费项目
2012-05-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
122-127
