两栖动物线粒体基因组tRNA基因重复、丢失及其影响

摘要：

在脊椎动物线粒体基因组中,偶有tRNA基因重复或丢失事件发生,这些事件因与相应氨基酸转运密切关联而凸显重要.两栖类中,这些重复或丢失相对多样,可为相关研究提供良好素材.为了解这些事件对氨基酸对应的密码子使用偏好是否产生影响,本文引入统计方法,检测10种两柄类mtDNA蛋白编码基因相对的同义密码子使用度(RSCU),并特别设计将发生tRNA基因重复或丢失物种与其近缘群进行对比分析.结果显示,tRNA基因的重复对密码子使用偏好没有显著的影响,推测可能与突变积累的时限和mtDNA紧凑性有关.另外,tRNA基因丢失也未使相应氨基酸密码子使用偏好产生明显的改变.推测在两栖类中,"tRNA转入"和"tRNA反密码子摆动位点的超级摆动"可能是tRNA基因丢失的补偿方式.

关键词：两栖类、线粒体基因组、密码子使用偏好、tRNA基因重复、tRNA基因丢失

所属期刊栏目：16

分类号：Q959.506(动物学)

资助基金：国家自然科学基金;中国科学院知识创新工程重要方向项目

在线出版日期：2011-04-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：822-827