DNA条形码识别Ⅵ:基于微型DNA条形码的果实蝇物种鉴定
选用双翅目实蝇科12属36种55个样本为材料,将其DNA条形码(mtDNACOI基因648 bp)与微型DNA条形码(mtDNACOI基因50～200 bp)数据进行比较分析,探讨微型DNA条形码对果实蝇物种鉴定的可行性.采用虚拟实验(Silico analysis),将BOLD数据库中49个样本的序列分别拆成648 bp、160 bp、50 bp三个片段,通过构建NJ树,并进行遗传距离分析,得出每个片段鉴定物种的准确性依次为100%、94%、84%.同时做了实体实验(Empirical test),得到了果实蝇属6个物种的COI序列,将其与虚拟实验中的49个样本序列合并,以DNA-barcode指定序列5'端160 bp序列为分析基础,通过遗传距离分析,得出其鉴定物种的准确性为94%,验证了虚拟实验结果.即微型DNA条形码(Minimalist-barcode)鉴定果实蝇物种的准确性与DNA条形码基本一致,均可作为果实蝇物种鉴定的有效依据.图2表1参29附1
实蝇科、COI基因、DNA条形码、微型DNA条形码、物种鉴定
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Q93;S96
国家内然科学基金项目30570250;国家质检总局科技计划项目2007IK242;国家重点基础研究发展规划项目2004CB318003;中国科学院知识创新重要方向基金项目KJCX2-YW-S02
2009-06-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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