ERIC-PCR:一种快速鉴别环境细菌菌株的方法

摘要：

以ERIC(肠杆菌基因间共有重多序列)序列设计的特异引物对3株大肠杆菌、3株软腐欧氏杆菌、2株草生欧氏杆菌、1株梨火疫欧氏杆菌、1株催娩克氏菌、1株阴沟肠杆菌和9株具有降酚能力的细菌等20种细菌的基因组DNA进行PCR分析.每种菌株均存在数目不等的各自独特的带型,能够区分同一种类中极为相近的菌株.经多次重复,各特异性扩增的主要带型能重复稳定出现.聚类分析的结果表明,供试菌株多数按照分类地位归到相应的组中.9种具有降酚能力的细菌中,2种分离自处理焦化废水池活性污泥,7种来自土壤样品.ERIC-PCR指纹图显示,前2种属于一类,都有一条大小约1.1 kb的主带,其它7种土壤中分离出来的细菌除其中1种有1条约1.2 kb大小的主带外,其余6种都有1条大小约1.4 kb的带.聚类分析将从土壤中分离出来的细菌归为3种不同的类型.ERIC-PCR可以从分子水平对细菌基因组进行快速指纹图分析,在对环境细菌分离物进行快速鉴定和归类等方面具有实用价值.

关键词：ERIC-PCR、细菌、DNA指纹图

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分类号：Q939.110.9;Q78(微生物学)

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：30-33