菊花脑GRAS家族鉴定及其低温胁迫响应表达分析

摘要：

利用生物信息的方法鉴定了菊花脑(Chrysanthemum nankingense)GRAS基因家族成员,并利用已发表的RNA-Seq数据分析了 CnGRAS在低温胁迫应答中的表达情况.结果表明:CnGRAS家族包含80个成员,可分为10个亚家族,同一个亚家族中各成员的基因结构和蛋白功能域高度保守.复制进化分析发现,CnGRAS家族的复制模式仅存在串联重复.GRAS在菊花脑中的表达具有组织特异性,多数在根和叶中表达水平较高.GO富集分析表明CnGRAS主要定位于细胞核,具有多种分子功能,参与多个生物学过程.RNA-Seq数据分析表明,14个CnGRAS至少在1种低温胁迫(短期低温或长期低温)条件下呈现差异表达,其中 CnGRAS32、GnGR4S33、CnGRAS40、CnGRAS44、CnGRAS56、CnGRAS74 和CnGR4S79呈现出显著上调表达,说明这些基因可能在菊花脑响应低温胁迫中起着重要作用.

关键词：菊花脑、GRAS、转录因子、低温胁迫、表达分析

所属期刊栏目：50

分类号：S644.9

资助基金：浙江省基础公益研究计划项目;浙江省自然科学基金项目;大学生创新创业训练计划项目

在线出版日期：2023-05-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共16页

页码：815-830