睡莲WRKY家族的全基因组鉴定和分子进化分析

摘要：

在睡莲中共鉴定出69个NcWRKY转录因子,将其分成3个亚家族,即Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ,其中Ⅱ亚家族可进一步分为Ⅱa、Ⅱb、Ⅱc、Ⅱd和Ⅱe,与拟南芥中WRKY亚家族分类相同.Ⅱc亚家族中含有17个成员,是睡莲WRKY家族中成员数最多的亚家族.所有成员的蛋白质二级结构中无规则卷曲所占比例高达为39％～78％.motif 1和motif 3被注释为WRKY保守结构.NcWRKY成员在睡莲14条染色体中均有分布,其中Ⅱa亚家族中所有成员都定位在Nc4号染色体.启动子顺式调控元件分析发现,NcWRKY成员广泛参与激素调控反应,通过不同组织中表达量分析筛选出在成熟叶柄中高表达的NcWRKY04与NcWRKY18,在花瓣中高表达的McpRKY05和在雄蕊中高表达的NcWRKY61.基因复制事件分析发现,NcWRKY家族主要以片段复制事件为主.基因表达网络关系分析预测NcWRKY61和NcWRKY63可能与其他成员有共表达关系.

关键词：睡莲、WRKY、全基因组鉴定、分子进化

所属期刊栏目：49

分类号：S682.32(观赏园艺（花卉和观赏树木）)

资助基金：国家自然科学基金;中国博士后基金;中国博士后基金;福建农林大学杰出青年科研人才计划项目;福建农林大学科技创新专项基金项目;福建省自然科学基金项目

在线出版日期：2022-06-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共15页

页码：1121-1135