番木瓜成熟过程中全基因组DNA甲基化和转录组变化分析

摘要：

采用全基因组DNA甲基化(WGBS)和转录组测序(RNA-seq)技术对番木瓜4个成熟时期(绿熟期、破色期、熟化期、腐熟期)的果实样品进行高通量测序.C位点、CG、CHG和CHH序列平均甲基化水平分别为17.15％、49.33％、34.30％和8.28％.全基因组DNA甲基化水平在果实成熟过程中持续下降,同时差异表达基因(DEG)数量逐渐上升.全基因组DNA甲基化和转录组数据联合分析表明,基因表达水平与启动子及基因体甲基化水平呈显著正相关.筛选出CpACO4、CpPDS、CpXTH30 和CpXTH31等4个番木瓜果实成熟差异表达候选基因,利用荧光定量PCR和McrBC-PCR分别检测其表达水平和相应DMR序列甲基化水平,结果分别同转录组和全基因组DNA甲基化一致,推测这些基因在番木瓜果实成熟过程中起重要作用.

关键词：番木瓜、果实、成熟、全基因组、DNA甲基化、基因、差异表达

所属期刊栏目：49

分类号：S667.9(果树园艺)

资助基金：广东省基础与应用基础研究基金项目;广州市科技计划项目;广东省现代农业产业技术体系创新团队建设项目;广州市基础与应用基础研究一般项目

在线出版日期：2022-04-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共14页

页码：519-532