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10.16420/j.issn.0513-353x.2020-0911

甜樱桃GH3基因家族全基因组鉴定与表达分析

引用
以甜樱桃(Prunus aviumL.)为材料,对IAA酰胺合成酶(Gretchen Hagen 3,GH3)基因家族全基因组进行鉴定及生物信息分析;同时,分析其在不同组织中的表达及对外源GA3、ABA、MeJA、IAA的响应.结果 表明,甜樱桃基因组中共存在8个GH3基因,根据在染色体的位置依次命名为PavGH3.1~PavGH3.8,编码区长度为1683~1851 bp,预测大多数基因定位在叶绿体中;PavGH3外显子数3或4,且有较多保守基序;除5号和7号染色体外,其他染色体均有分布;启动子存在ABA、MeJA等6种激素响应元件;PavGH3在进化上分为2组,且PavGH3.5和PavGH3.6与拟南芥GH3一些成员存在共线性.表达分析显示,PavGH3.2、PavGH3.6和PavGH3.7为3个主要表达基因.PavGH3.4和PavGH3.5在第2次生理落果中较第1次上调表达,与正常果实相比,第1次生理落果中PavGH3.5和PavGH3.7下调表达,PavGH3.4和PavGH3.6上调表达.PavGH3.2、PavGH3.3、PavGH3.6和PavGH3.7为主要响应激素的基因.推测PavGH3基因家族广泛参与甜樱桃的生长发育,且可能与落果关系密切.

甜樱桃;IAA酰胺合成酶;基因家族;生长素响应;表达分析

48

S662.5(果树园艺)

贵州省农业攻关项目;贵州省高层次创新型人才培养项目

2022-03-07(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共15页

2360-2374

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园艺学报

0513-353X

11-1924/S

48

2021,48(12)

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