硫化氢控制鲜切苹果褐变的可变剪切基因分析

摘要：

利用RNA-seq测序技术分析了H2S处理和对照鲜切苹果两个贮藏时间点(0和6d)样品的可变剪切,从中挖掘与H2S控制鲜切苹果褐变相关的基因可变剪切.结果 表明,4组样品中基因可变剪切均以第1个外显子可变剪切(TSS)和最后1个外显子可变剪切(TTS)为主.与对照组同时期样品相比,H2S处理0和6d特有的可变剪切基因分别有921和2423个,GO分析结果表明两组样品的特有可变剪切基因主要富集在黄酮合成、细胞质、膜结构、水解酶、氧化还原酶活性等,KEGG富集分析表明上述基因主要富集在植物—病原菌相互作用、植物激素信号转导、碳水化合物代谢、氧化磷酸化、苯丙烷生物合成等代谢通路.此外,H2S处理抑制了多酚氧化酶(PPO)、过氧化物酶(POD)、脂氧合酶(LOX)和磷脂酶D (PLD)等基因的表达,同时提高了苯丙氨酸解氨酶(PAL)和NADH脱氢酶基因的表达.综上,H2S处理可能是通过改变过氧化物酶、苯丙烷代谢、膜结构以及能量代谢相关基因的可变剪切及表达模式,从而控制鲜切苹果褐变反应.

关键词：苹果;鲜切;褐变;硫化氢;可变剪切

所属期刊栏目：48

分类号：S661.1(果树园艺)

资助基金：国家重点研发计划;国家自然科学基金;大连市青年科技之星项目

在线出版日期：2022-01-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：2121-2132