10.16420/j.issn.0513-353x.2021-0205
黄瓜核心种质白粉病抗性的全基因组关联分析
以231份来自世界各地的黄瓜核心种质为材料,于2017和2018年在北京和广州进行白粉病抗性鉴定,利用基因组重测序检测的950382个SNPs进行全基因组关联分析.结果 表明,黄瓜白粉病在广州地区的自然发病率显著高于北京地区,不同种质在两年病情指数(DI)之间存在较高的相关性;基于混合线性模型,共检测到12个显著关联信号,分布于1号、5号和6号染色体上,其中,pm1.1在北京的两年中被重复检测到,pm5.7在广州的两年中被重复检测到;显著关联信号中共有68个超过阈值[log10(P value)=6.0]的SNP,包含1个外显子区非同义突变SNP (Chr5:16676542),位于编码异嗜性和多嗜性逆转录病毒受体蛋白基因XPR (Csa5G471600)上;在与白粉病抗性相关联SNP的LD区段内共检测到63个候选基因,其中7个候选基因的表达量在高抗材料接种白粉病前后出现显著差异.
黄瓜;白粉病;全基因组关联分析;单核苷酸多态性;候选基因
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S642.2
国家"十三五"重点研发计划项目;中国农业科学院创新工程项目CAAS-ASTIP-IVFCAAS;中央级公益性科研院所基本科研业务费专项;农业农村部作物种质资源保护项目;农业农村部作物种质资源安全保存项目;国家园艺种质北京蔬菜分库运行服务项目;国家作物种质资源数据中心观测监测任务项目
2021-09-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共15页
1371-1385
