辣椒B-box转录因子家族的鉴定及表达分析

摘要：

以辣椒基因组数据为基础,利用生物信息学方法,对辣椒B-box家族基因进行了染色体定位、基因结构、系统进化及组织表达模式等分析,并通过qRT-PCR方法对该家族基因在激素及非生物胁迫下的转录水平进行了检测.辣椒全基因组中共鉴定出26个BBX家族成员,分布于辣椒12条染色体上.系统进化分析分析发现,辣椒BBX蛋白成员可进一步分为5类:group Ⅰ～Ⅴ.其中,group Ⅰ包含两个B-box结构域;group Ⅱ和Ⅲ中的蛋白除CaBBX25外,都包含B-box1、B-box2和CCT结构域;groupⅣ仅包含1个B-box结构域;groupⅤ含有1个B-box和1个CCT结构域.同一进化分类中的成员通常具有相同或者相似的外显子数,其蛋白中保守基序的构成也具有较高的相似性.组织特异性表达分析发现,除D类基因外,其他17个基因在不同器官或者果实的不同发育时期都有着较高的表达水平.qRT-PCR分析发现,10个CaBBX基因受到激素和非生物胁迫不同程度的诱导表达.

关键词：辣椒、B-box转录因子、鉴定、表达分析

所属期刊栏目：48

分类号：S641.3

资助基金：重庆市自然科学基金面上项目;重庆三峡学院博士引进项目;重庆市渝东北特色生物资源开发利用工程技术研究中心项目

在线出版日期：2021-07-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共15页

页码：987-1001