葡萄LIM家族基因特征及表达模式分析

摘要：

为了明确LIM家族基因在葡萄非生物胁迫下的表达特性,在生物信息分析的基础上,以'黑比诺'葡萄(Vitis vinifera‘Pinot Noir’)试管苗为试验材料,利用qRT-PCR技术检测了不同逆境处理对葡萄LIM家族基因成员表达的影响.结果 显示,葡萄LIM基因家族有14个成员,可分为4个亚族,各亚族编码蛋白氨基酸数量差异较大,但亚族内差异较小;分析葡萄基因和拟南芥基因间的选择压发现,二者存在钝化选择关系;多序列比对发现,该家族基因成员含有1或2个锌指结构的保守结构域;保守基序分析结果表明,所有基因均包含motif2;基因结构显示VvLIM含有4～15个外显子;14个基因中有11个编码蛋白存在互作关系.该家族基因存在大量的光诱导元件和水杨酸等逆境胁迫相关元件.基因芯片表达数据表明,高表达的基因主要存在生长旺盛的组织中.qRT-PCR分析发现,VvLIM1在100 mmol· L-1 NaCl、10％ PEG和50 mg·L-1 SA胁迫下表达量与对照相比显著上调,且随处理时间的延长表达量显著增加.

关键词：葡萄、LIM基因家族、生物信息学分析、qRT-PCR、非生物胁迫

所属期刊栏目：47

分类号：S663.1(果树园艺)

资助基金：甘肃农业大学青年导师基金项目;甘肃省陇原创新团队项目;甘肃省葡萄酒产业发展专项;甘肃省科技重大专项

在线出版日期：2020-09-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：1277-1288