中国樱桃LTR类反转录转座子反转录酶序列的克隆和分析

摘要：

利用同源序列法根据Ty1-copia和Ty3-gypsy类反转录转座子反转录酶保守区设计简并引物,从中国樱桃(Prunus pseudocerasus Lindl.)中分别扩增出约260和430bp的目标片段,并进行克隆、测序、序列分析及转录活性检测.共获得44条Ty1-copia类反转录酶序列,13条Ty3-gypsy类反转录酶序列,序列间显示高度异质性,部分序列存在缺失、终止密码子及移码突变.系统发育树显示Ty1-copia可以分为TAR、Ale两类,Ty3-gypsy可以分为Tat、Reina、Tekay等3类.Ty1-copia和Ty3-gypsy类反转录酶dN/dS值均小于1,并且Ty3-gypsy高于Ty1-copia.13条Ty1-copia以及7条Ty3-gypsy反转录酶序列在樱桃正常生长条件下均有转录活性,但不受8种非生物胁迫的诱导.PpRT7在高温(42℃)胁迫24 h时转录活性升高,并且具有组织特异性.

关键词：樱桃、中国樱桃、Ty1-copia、Ty3-gypsy、反转录酶、序列分析、转录活性

所属期刊栏目：47

分类号：S662.5(果树园艺)

资助基金：贵州省农业攻关项目黔科合支撑[201612520

在线出版日期：2020-05-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共15页

页码：355-369