茶树TCP转录因子的鉴定与表达分析

摘要：

基于茶树基因组数据,通过生物信息学方法,对茶树全基因组TCP家族成员进行染色体定位、基因结构、编码蛋白特性和系统进化关系分析,同时采用荧光定量PCR验证茶树TCPs在不同组织部位的相对表达水平.结果 表明,茶树全基因组中共鉴定出36个具有典型TCP保守结构域的转录因子基因,其CDS全长和编码氨基酸的数量分别在453～1 824 bp和150～607 aa之间,命名为CsTCPI～CsTCP30.系统进化分析显示,茶树TCP转录因子家族可分为2个亚族:Class Ⅰ和Class Ⅱ,并可进一步分为8个亚组(A～H),其中ClassⅠ亚族中的TCP蛋白属于PCF或TCP-P类型,而Class Ⅱ可分为CYC/TB1和CIN两种类型.基因结构和保守结构域分析结果显示,同一亚组内,TCP蛋白具有相似的氨基酸结构和保守区域,而不同亚组之间具有较大差异,暗示不同类型TCP转录因子可能具有独特的生理功能.除CsTCP21b外,其余35个CsTCP基因在茶树叶片不同生长时期均有表达,但其表达水平呈现不同趋势;荧光定量分析显示其家族成员具有组织表达特异性;外源GA3和ABA处理可以显著激活或抑制该家族基因成员的表达.

关键词：茶树、TCP转录因子、全基因组、系统进化分析、定量表达

所属期刊栏目：46

分类号：S571.1

资助基金：国家自然科学基金项目31670691,31500567,31470692

在线出版日期：2020-04-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共14页

页码：2369-2382