10.16420/j.issn.0513-353x.2018-0753
龙眼EST-SSR标记开发及无患子科5个属种质遗传多样性分析
基于龙眼品种‘香脆’果实的转录组测序数据库,开发龙眼EST-SSR引物,评价其在无患子、红毛丹、荔枝、龙荔等4个近缘属植物上的通用性,并进行无患子科5个属55份种质的遗传多样性分析.在13 934条龙眼Unigene中搜索到SSR位点6 683个,SSR发生频率为47.96％,平均分布距离为4.48 kb;单、二和三核苷酸重复是主要的SSR类型,分别占52.78％、26.25％和20.19％;设计出4 670对SSR引物,随机合成185对不同重复类型的SSR引物进行验证,有效扩增率为78.92％(146对),其中多态性引物占34.25％(50对),条带多态率50％～ 100％;龙眼多态性引物在无患子属、韶子属、荔枝属、龙荔属等4个近缘属上的转移率分别为38.30％、38.30％、68.09％和74.47％.UPGMA聚类分析显示,55份材料在遗传相似系数0.561处明显地划分为龙眼、龙荔、荔枝、无患子和红毛丹5个大类.
无患子科、龙眼、SSR、转录组
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S667.2(果树园艺)
国家自然科学基金项目31701884;省属公益类科研院所基本科研专项2018R1013-5;国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目CARS-32-06;福建省农业科学院科技创新团队项目STIT2017-1-4;农业农村部物种品种资源保护热带作物项目151821301354052701;国家万人计划——百千万领军人才项目2016-
2019-09-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共14页
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