哈氏黄瓜NAC转录因子的鉴定及低温表达分析

摘要：

以哈氏黄瓜(Cucumis sativus vat.hardwickii)为试验材料,基于全基因组测序结果,利用生物信息学分析方法,鉴定获得77个NAC转录因子,其结构高度保守,序列长度在151 ～ 653个氨基酸之间,在7条染色体中呈非均匀分布;理论等电点在4.54 ～ 9.10之间;大部分转录因子定位在细胞核和细胞质膜上;系统发生分析显示所有NAC转录因子聚类为6个亚家族,其中亚家族Ⅲ序列结构较为多样性;进化分析发现NAC转录因子存在片段重复和串联重复等复制模式,没有发生近代的全基因组复制事件,并在进化过程中受到纯化选择作用;NAC转录因子基因在哈氏黄瓜幼苗根中表达量最高,其次为雌花和叶片;荧光定量分析发现,低温处理下,检测的15个NAC基因中有12个显著上调表达,3个下调表达,并存在一组表达量差异明显的HdNAC32-HdANC47片段复制基因对.由此可知NAC转录因子在受低温胁迫的哈氏黄瓜中发挥重要的转录调控作用.

关键词：黄瓜、哈氏黄瓜、NAC转录因子、低温胁迫、基因表达

所属期刊栏目：46

分类号：S642.2

资助基金：国家自然科学基金重点项目3140075;国家重点研发计划项目2016YFD0100203-25;江苏省重大品种创制项目PZCZ201719

在线出版日期：2019-09-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共17页

页码：1303-1319