苹果WUSCHEL-related homeobox (WOX)家族基因的鉴定与分析

摘要：

利用生物信息学方法和苹果基因组数据库,鉴定并分析了12个苹果WUSCHEL-related homeobox (WOX)家族基因.系统进化树分析表明,苹果WOX家族和拟南芥WOX家族可被分为现代分支(WUS分支)、中间分支和祖先分支;苹果WOX家族成员均含有1个motif-1,不同分支的成员含有其分支特异的motif;基因结构分析显示,苹果WOX家族基因含有2～4个外显子,染色体定位发现11个基因分别定位在苹果的7条染色体上,1个基因无准确定位.基因表达模式分析表明,12个基因在苹果各组织中均有表达,且在果实中的表达量较高;密码子偏好性分析显示,苹果WOX家族基因的偏好性较弱.

关键词：苹果、WOX家族、生物信息学、基因表达

所属期刊栏目：46

分类号：S661.1(果树园艺)

资助基金：国家自然科学基金项目31601728;山东省自然科学基金项目ZR2016CQ13;山东农业大学杰出青年基金项目564024,24024

在线出版日期：2019-07-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：1021-1032