红富士苹果芽变系DNA甲基化研究

摘要：

以35份富士苹果(Malus×domestica Borkh.‘Fuji’)芽变材料为试材,利用甲基化敏感扩增多态性(Methylation Sensitive Amplified Polymorphism,MSAP)分析和UPGMA聚类方法,对其基因组甲基化修饰水平、变异模式以及表观遗传变异关系进行研究.结果 表明:(1)不同富士系得到不同的MSAP扩增,总DNA甲基化水平27.90％ ～ 36.16％,平均32.87％,双链全甲基化为主要甲基化方式;(2)富士芽变材料绝大多数位点保持了原有甲基化模式;(3)绝大多数芽变(68.57％)检测到全部的甲基化变异模式(12种),去甲基化频率极显著高于甲基化频率(P＜0.01),且CG去甲基化极显著高于CHG;(4) 36份种质遗传相似系数平均值0.89 (0.79～ 0.92),在聚类图上,富士原种分布在芽变系集中区外,新近发生的芽变系更倾向于聚在一起,着色系片红型和条红型芽变呈分散排布状态.总的来看,富士芽变的甲基化变异模式丰富,超甲基化和去甲基化相伴发生,但以去甲基化为主;‘富士’着色芽变与其最原始品种富士,以及芽变之间发生了较大表观遗传变异;片红和条红型芽变聚类未表现明显偏好性.本研究将为进一步开展富士着色系芽变机理研究提供指导,可以CG去甲基化为切入点展开深入研究.

关键词：富士苹果、着色系芽变、DNA甲基化、甲基化敏感扩增多态性、表观遗传变异

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分类号：S661.1(果树园艺)

资助基金：山东省博士后创新项目专项资金项目201702051;国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目CARS-27;山东省泰山学者种业人才团队建设项目

在线出版日期：2019-03-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共14页

页码：107-120