基于叶绿体DNA信息的南方梨属种质的遗传多样性和演化分析

摘要：

选取5个叶绿体DNA非编码区trnL-trnF-1、trnL-trnF-2、trnS-psbC、accD-psaI、rps16-trnQ和1个基因区域rbcL,对中国秦岭淮河以南地区的梨(Pyrus L.)资源进行遗传多样性和演化分析.将188份梨资源的测序结果整合得到长度为5 612 bp(包含缺失片段),共检测出13个单倍型、4个单一突变位点、16个简约性信息位点和14个插入/缺失片段(InDels),单倍型多样性Hd为0.7178,核苷酸多样性为0.35×10-3.accD-psaI区域的分析结果显示该区域的Hd值最高,为0.7177;rbcL区域的Hd值最低,为0.0317.其中162份梨资源检测出12个单倍型,Hd为0.713,核苷酸多样性为0.29×10-3;梨的不同地理群体中湖南省的10个梨地方品种的Hd最高,为0.889;来自贵州省的8个品种的Hd最低,为0.138份砂梨地方品种共检测出8个叶绿体单倍型,其中单倍型H2、H4和H5在130份砂梨和37份白梨品种中检测到,单倍型H6、H10、H11、H12和H13在8份砂梨地方品种‘青皮钟’、‘甜宵梨’、‘细花红梨’、‘惠阳红梨’、‘麝香梨’、‘塘湖青’、‘红粉’和‘横县浸泡梨’中检测到.Median-joining Network图显示单倍型H6和H11为古老单倍型,H1、H4和H5为较进化的单倍型.根据叶绿体DNA序列变异信息可推测秦岭淮河以南地区的砂梨和白梨亲缘关系较近,同时来自湖南地区的砂梨种质资源具有丰富的遗传多样性.

关键词：梨、种质、叶绿体DNA、遗传多样性、演化分析

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分类号：S662.1(果树园艺)

资助基金：国家自然科学基金项目31272128;国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目CARS-29-01;中国农业科学院科技创新工程项目

在线出版日期：2019-01-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共13页

页码：2308-2320