丹参细胞分裂素调控因子序列特征分析

摘要：

细胞分裂素通过双元信号系统感知外界环境刺激并作出应答.其中细胞分裂素响应调控因子(response regulator,RR)是该双元信号系统中的重要构成.采用生物信息学的方法,对丹参(Salvia miltiorrhiza)细胞分裂素调控因子进行序列特征和组织表达特性分析.结果发现,丹参基因组中共有15个丹参细胞分裂素调控因子SmRR,序列比对与系统发生分析表明,SmRR1 ～ SmRR7与拟南芥A类RR亲缘关系比较接近,划分为A类RR,SmRR8 ～ SmRR15与拟南芥B类RR亲缘关系近,归为B类;在A类SmRR中,REC接受域含有保守的DDK残基,因此这些基因被推测有完整的功能,B类SmRR具有高度保守Myb_SHAQKYF结构域.两类SmRR的内含子、外显子组成也具有相对的保守性,顺式调控元件的分析发现,SmRR存在很多胁迫和生长调节物质的响应元件.表达量热图显示A类和B类SmRR基因分别在叶和根中表达量较高.

关键词：丹参、细胞分裂素调控因子、生物信息学

所属期刊栏目：45

分类号：S567.5+3(经济作物)

资助基金：国家自然科学基金项目81001603,81872949;山东省重点研发计划重点关键技术项目2016ZDJS07A22,2017CXGC1302

在线出版日期：2019-01-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：2217-2227