10.16420/j.issn.0513-353x.2017-0883
苹果CR4基因家族鉴定与表达分析
以RCC1 (PF00415)、TNFR_c6 (PF00020)和Pkinase (PF00069)保守域全蛋白序列为种子序列,在苹果全基因组范围比对分析了CRINKLY4 (CR4)家族成员,对其理化性质、进化关系、染色体分布等进行了分析;基于qPCR分析了CR4基因在苹果腐烂病发生和低温胁迫过程中的表达情况.通过分析,共获得8个苹果CR4基因,其氨基酸序列大小介于668~1 690,分子量介于71.73 ~ 187.61 kD,等电点介于5.69 ~ 8.66,主要位于质膜;根据进化分析将其分为两个亚组.PCR表达分析结果表明,CR4基因在苹果不同组织和品种间存在不同的表达模式.分别有8个和6个CR4基因在苹果花芽感受低温和接种腐烂病菌后至少在1个时间点发生差异表达.其中,MD03G 1068800在花芽感受低温后上调达25倍以上,而MD00G 1166500和MD01G1153100在腐烂病发生后上调达150倍以上,以上3个CR4基因可作为后续功能研究的候选基因.
苹果、CR4、生物信息学分析、低温、腐烂病、表达
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S661.1(果树园艺)
甘肃农业大学学生科研训练计划SRTP项目20171028;国家自然科学基金项目31860545,31501728;甘肃省科技重大专项18ZD2NA006;甘肃农业大学引进人才专项GSAU-RCZX201712
2018-12-10(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共11页
2019-2029