10.16420/j.issn.0513-353x.2017-0675
越橘叶片转录组SSR发掘及其多态性研究
对高丛越橘品种‘布里吉塔’叶片转录组序列进行了简单重复序列(SSR)位点搜索和分析,发现了22 058个SSR位点,总发生频率为21.32%.SSR重复类型以二核苷酸发生频率最高(77.70%),三核苷酸次之(21.45%).选用53对SSR引物在8个越橘属植物中进行PCR扩增,筛选出15对条带清晰且能稳定扩增的SSR核心引物.使用核心引物对39份越橘属种质进行分析,有效等位基因数最大值为7.11 (VcSSR19),最小值为1.41 (VcSSR41),平均值为3.90.香农多样性指数变化范围是0.64 ~ 2.31,平均值为1.55.观察杂合度和期望杂合度的变化范围分别是0.050 ~ 0.900和0.293 ~ 0.870,平均值分别为0.457和0.677.使用5对引物可以完全区分39份种质中的38份.南高丛越橘品种‘莱格西’和‘蓝雨’与蔓越橘品种、越橘属野生种具有更近的亲缘关系,是与野生种进行杂交育种的合适种质.
越橘、转录组、SSR、亲缘关系、多态性
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S663.9(果树园艺)
浙江省自然科学基金项目LQ16C150001;浙江省农业新品种选育重大科技专项2016C02052-9;浙江省“重中之重”学科生物学开放基金;浙江师范大学博士基金科研项目
2018-08-31(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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