朱顶红实时荧光定量PCR中不同组织器官内参基因的筛选

摘要：

以朱顶红(Hippeastrum vittatum)不同组织器官为试验材料,通过实时荧光定量PCR技术检测肌动蛋白基因(ACT)、亲环蛋白基因(CYP)、转录延伸因子基因(EF-1a)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因(GAPDH、GAPDH2)、α微管蛋白基因(TUA)和β微管蛋白基因(TUB)这7个常用的看家基因的表达水平,并利用geNorm、NormFinder和BestKeeper综合评价其表达稳定性.结果表明,EF-1a和GAPDH2的表达水平较高,而且相对稳定;其次为TUB、TUA和GAPDH.geNorm和NormFinder软件分析结果显示,在不同组织器官中CYP和GAPDH2的表达稳定性最高,其次是EF-1a;进一步分析表明,CYP的表达稳定性虽然较高,但是其表达丰度较低,故不适合作为内参基因.BestKeeper分析表明,EF-1a和GAPDH2在不同组织器官中的表达稳定性较好.综合分析表明,EF-1a和GAPDH2在所有样品中表达量较高,稳定性较好.以筛选出来的EF-1a、GAPDH2以及EF-1a+GAPDH2作为内参基因检测朱顶红花器官调控基因PI的表达水平,结果表明,以上述两个基因及其组合为内参基因得到的PI表达模式相同,而且在花器官中的表达高于茎盘和根,基本符合PI调控花模型的机理.因此,EF-1a、GAPDH2或EF-1a+ GAPDH2可作为朱顶红的内参基因进行相关基因的表达调控研究.

关键词：朱顶红、实时荧光定量PCR、内参基因、EF-1α、GAPDH2

所属期刊栏目：45

分类号：S682.2+5(观赏园艺（花卉和观赏树木）)

资助基金：中国农业科学院科技创新工程项目;中国科协青年人才托举工程项目2015QNRC001

在线出版日期：2018-08-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：919-930