10.16420/j.issn.0513-353x.2017-0848
利用黄秋葵转录组信息挖掘SSR标记及用于种质分析
通过对黄秋葵(Hibiscus esculentus L.)转录组信息分析,共获得74 600条unigene,全部序列有52 976 011 bp;有3 191条unigene包含SSR的序列,从中鉴定出3 448个SSR位点,其中有235条序列包含1个以上SSR,复合SSR有123个.优势重复基序为三核苷酸和二核苷酸,分别占总SSR的60.79％和21.43％.二核苷酸重复基元中以AG/CT为优势重复基元,占总位点的11.02％,三核苷酸重复基元以AGA/TCT为主,占总位点的19.61％.利用Primer 3.0共设计出8 088对SSR引物.从87对有效扩增引物中随机选择60对用于32份黄秋葵种质的多态性验证分析,其中36对(占60％)引物表现稳定可重复的多态性.利用UPGMA作图,将32份供试材料分为2类.利用黄秋葵转录组数据进行SSR标记开发,能获得较高频率的SSR位点,且类型丰富,为其遗传多样性分析和遗传图谱构建提供更丰富可靠的标记选择.
黄秋葵、转录组、SSR、多态性
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S649
福建省属公益类科研院所基本科研专项2015R1026-9;福建省农业科学院蔬菜科技创新团队项目STIT2017-1-2;福建省农业科学院“青年科技英才百人计划”项目YC2017-5;国家特色蔬菜产业技术体系项目CARS-24-G-07
2018-06-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共12页
579-590
