草莓FaCOP1的克隆及其表达特异性分析

摘要：

为探索草莓光形态建成抑制子FaCOP1的功能及其表达特异性,采用同源克隆法获得‘丰香’草莓FaCOP1的完整开放阅读框序列,对该序列及其编码的氨基酸序列进行相关生物信息学分析,同时采用qRT-PCR分析该基因的时空表达以及在不同光质处理下的表达模式.结果表明,FaCOP1开放阅读框全长1 989 bp,GenBank登录号为KX583676,编码662个氨基酸,蛋白质分子量为74.7187kD,理论等电点为6.54,具有环形锌指域,卷曲螺旋域和WD40重复序列等3个保守结构域.序列比对以及系统进化树分析发现,COP1进化过程中具有高度保守性以及物种间的差异性.qRT-PCR结果表明,FaCOP1在草莓的根、茎、叶、花及成熟果实中均有表达,花中的表达量最高,其次是叶和根,而茎和成熟果实中最少.随着草莓果实的发育(从小绿期到全红期)FaCOP1的转录水平总体呈现递减的规律,与果实花青素积累模式相反.草莓叶片和果实的FaCOP1表达均能够被白、红、蓝及红蓝光(1∶1)诱导.FaCOP1在转录水平上没有阻遏FaHY5的表达,其关系需在蛋白质水平上进一步验证.

关键词：草莓、FaCOP1、生物信息学分析、表达特异性、光质、光形态建成

所属期刊栏目：44

分类号：S668.4(果树园艺)

资助基金：四川省博士学科点提升计划项目

在线出版日期：2017-05-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：547-556