10.16420/j.issn.0513-353x.2016-0100
高羊茅EST-SSR标记开发及遗传多样性分析
采用从其他作物转移与利用自身EST序列设计两种方法为高羊茅(Festuca arundinacea L.)开发EST-SSR分子标记,并利用所开发标记对高羊茅品种(系)进行遗传多样性分析.利用来自小麦、大麦、玉米、高粱和水稻的732对EST-SSR在高羊茅上进行通用性分析,得到406个有效的扩增引物对(55.46％).利用高羊茅EST数据库(GenBank/dbEST)中63 853条EST序列进行微卫星序列的查找,共发现包含微卫星的EST序列420条,占整个EST总数的0.658％.其中三核苷酸基序出现频率最高(43.33％),次之为二核苷酸基序(33.57％).二核苷酸基序以CT/GA出现频率最高(16.90％),三核苷酸基序以CAG/GTC出现的频率最高(10.63％).进一步运用Primer 5.0软件设计了108个引物对,并交上海桑尼公司合成.PCR检测表明,92个引物对(85.19％)在高羊茅中均可以扩增出稳定清晰的带型.从498对(其中5种作物的406对,高羊茅的92对)有效扩增的EST-SSR引物中随机选取81对引物,对12个高羊茅品种(系)进行扩增.79个引物对显示出多态性(97.53％).共检测到133个等位变异,平均每对引物有1.68个等位变异;多态性信息含量(PIC)值最高为0.66,最低为0.14,平均为0.48.聚类分析结果表明,12份材料在相似系数为0.61处可分为5大类:第Ⅰ类为‘爆发力’和‘法思’;第Ⅱ类为‘强劲,、‘家园,和‘翠碧A’;第Ⅲ类为‘可其思3号’和‘凌志’;第Ⅳ类为‘雅典娜2号’、‘美洲虎3号’、‘火凤凰’和‘TF160’;‘球道’单独为第V类.
高羊茅、EST-SSR、通用性、标记开发、遗传多样性
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S688.4(观赏园艺（花卉和观赏树木）)
山东省重点研发计划项目2016CYJS05A02;国家自然科学基金项目31271712;山东省高等学校科技计划项目J09LC15;山东农业大学青年创新基金项目23822
2017-03-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
2401-2411
