苹果全基因组多聚半乳糖醛酸酶基因家族的鉴定及进化分析

摘要：

从苹果全基因组中鉴定出85个多聚半乳糖醛酸酶(PG)基因,通过聚类分析将其分成了7个组(GroupA ～ Group G),其分子量在176～1 125aa之间,等电点在4.68～9.58之间.鉴定出来的MdPG基因除在14号染色体没有分布外,其余都有分布.系统分析了MdPG蛋白的保守基序和MdPG基因结构,发现苹果PG蛋白除包含有广泛存在于各种PG蛋白的4个保守基序以外,还含有其他相对特异的保守基序,MdPG75具有最多的外显子数,达到18个.对85个苹果PG蛋白之间的功能联系网络进行了系统研究,分析预测了相关基因的功能和多个基因间功能的联系,并作了初步验证.

关键词：苹果、PG、家族分析、生物信息学

所属期刊栏目：43

分类号：S666.1(果树园艺)

资助基金：国家科技支撑计划项目2013BAD20B03;国家星火计划项目2014GA850002;国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目CARS-28;国家苹果改良中心杨凌分中心,陕西省农业科技创新与攻关项目2015NY114;陕西省果业发展协同中心和陕西果业发展项目

在线出版日期：2016-12-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1863-1877