辣椒TPS家族成员的鉴定与CaTPS1的表达分析

摘要：

利用生物信息学方法,从辣椒全基因组数据库中共鉴定出11个辣椒TPS基因,除CaTPS3含有1个TPS和2个TPP结构域外,其余分别含有1个TPS和1个TPP结构域.11个CaTPS分为2类,Class Ⅰ包含3个基因(CaTPS1～CaTPS3),分别含有16、16和13个内含子,CaTPS1和CaTPS2含Motif l ～ Motif5各1个,而CaTPS含有2个Motif4和1个Motif3.Class Ⅱ包含8个基因(CaTPS4～CaTPS11),均含有2个内含子,且分别含Motif1 ～ Motif 6各1个.利用荧光定量PCR对CaTPS1在辣椒组织表达的特异性和低温应答模式进行分析,结果表明:CaTPS1在叶片中的表达量大约是根和茎中的5～6倍,说明CaTPS1的表达具有明显的组织特异性;低温处理后CaTPS1在根和茎中的表达高峰出现时间明显早于叶片,说明不同组织中CaTPS1对低温胁迫的应答时间存在一定差异.

关键词：辣椒、海藻糖-6-磷酸合成酶基因、全基因组鉴定、基因表达

所属期刊栏目：43

分类号：S641.3

资助基金：国家自然科学基金项目31560555;农业部园艺作物生物学与种质创制学科群西北地区蔬菜科学观测试验站项目2015-A2621-620321-G1203-066;甘肃省农业科学院科技创新工程学科团队项目2015GAAS01;甘肃省农业科学院中青年基金项目2014GAAS27

在线出版日期：2016-10-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1504-1512