西瓜bHLH转录因子家族基因的鉴定及其在非生物胁迫下的表达分析

摘要：

利用生物信息学方法,在西瓜测序基因组97103中共鉴定出96个bHLH家族成员,其中有94个可以被定位到西瓜的11条染色体上.通过基因结构和结构域序列保守性的预测,发现这些基因的序列长度和内含子数量变化很大,但bHLH结构域序列比较保守.用拟南芥中39条已知的bHLH蛋白序列和西瓜的96条bHLH蛋白序列构建系统发育树,结果显示西瓜的bHLH家族可以进一步被分为11个亚族.运用荧光定量实时PCR技术,分析了该家族中21个基因在西瓜响应非生物胁迫时的表达水平,结果表明,8个基因受低温胁迫诱导表达,13个基因受ABA胁迫诱导表达,14个基因受盐胁迫诱导表达.ClabHLH41 在3种胁迫下表达量均显著增加,说明其在低温、ABA和盐胁迫应答中可能发挥着重要作用.

关键词：西瓜、bHLH、全基因组鉴定、胁迫响应、基因表达

所属期刊栏目：43

分类号：S651(瓜果园艺)

资助基金：国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目CARS-26-18

在线出版日期：2016-04-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：281-294